La Conférence nationale des Étudiants Vice-Présidents d’Université a été fondée à Nice le 30 septembre 2001, lors des IXème Rencontres Nationales des étudiants Vice-Présidents d’Université (les étudiants assumant des fonctions avaient pris l'habitude de se réunir régulièrement entre eux, pour échanger leurs expériences et leurs projets, depuis plusieurs années). Elle a été durant près de 2 ans un
groupement de fait, sous la direction de Jean-Marc Giaume et de son équipe. La CEVPU est devenue une association en droit (association loi 1901) le 9 mars 2003, à la suite des XIIème rencontres, à Aix-en-Provence. Son premier Président fut Charles-Jacques Martinetti, alors Vice-Président étudiant de l’Université Aix-Marseille III. Elle est l’aboutissement de nombreux débats tenus lors des rencontres précédentes, mais elle est aussi et surtout le signe de la prise de conscience progressive de la nécessité d’une telle structure pour asseoir l’action des Vice-Présidents, promouvoir les liens entre eux et favoriser le partage de leurs expériences et compétences respectives. Initialement désignée comme "Conférence des Vice-Présidents Étudiants d’Université" (C.V.P.E.U.), l'association a modifié ses statuts et pris son nom actuel de Conférence nationale des Étudiants Vice-Présidents d’Université (C.E.V.P.U.), à la suite de la décision de son Assemblée Générale, le 8 février 2004, à Strasbourg afin de répondre à deux objectifs stratégiques :
1/ Affirmer clairement son caractère de structure nationale.
2/ Affirmer l'importance du rôle des étudiants assumant les fonctions de Vice-Président d'Université en n'encouragent pas l'usage du terme de "Vice Président Étudiant" (V.P.E.), alors galvaudé dans certaines Universités au point de laisser penser qu'il existait une catégorie de vice-présidents différents des autres.