El Instituto de Investigaciones Filosóficas está dedicado a producir conocimiento original en filosofía, formar y actualizar a profesores e investigadores en dicha área, así como a difundir el conocimiento filosófico. En el IIFs se cultivan trece áreas de investigación: Epistemología, Estética, Ética, Filosofía de la ciencia, Filosofía de la mente, Filosofía de la religión, Filosofía del derecho,
Filosofía del lenguaje, Filosofía en México, Filosofía política, Historia de la filosofía e historia intelectual, Lógica y Metafísica. Sin embargo, lo que caracteriza la investigación filosófica en el Instituto es el ideal de hacer una filosofía pluralista, argumentada, rigurosa, clara y sistemática.